In vitro sensitivity of Malassezia furfur isolates from HIV-positive and negative patients to antifungal agents / Sensibilidad in vitro a antifúngicos de aislamientos de Malassezia furfur de pacientes positivos y negativos para HIV

Introduction. Malassezia is a lipophilic and lipid-dependent yeast genus belonging to the skin microbiota of humans and other animals. However, due to dysbiosis processes or other factors in the host, this yeast can cause different pathologies, ranging from skin diseases, such as seborrheic dermatitis, to fungemia. Isolation of Malassezia furfur has been reported in HIV-positive patients with or without skin lesions. Due to its opportunistic nature and its variable resistance to antifungal compounds, it is relevant to know the Malassezia sensitivity profiles. Objective. To determine the sensitivity to different antifungal agents, of clinical isolates of M. furfur obtained from HIV-positive or negative patients, with or without seborrheic dermatitis. Materials and methods. Assessment of isolates sensitivity to itraconazole, voriconazole, fluconazole, and amphotericin B was performed by two techniques: (1) Broth microdilution using Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) protocol M27-A3 with modifications; and (2) agar tests using Etest®. Results. Isolates obtained from HIV patients showed an increase in the minimum inhibitory concentration of fluconazole, voriconazole, and amphotericin B, compared with those of non-HIV patients. Itraconazole was the antifungal with the lowest minimum inhibitory concentration (MIC) in most isolates. Conclusion. We observed differences in the sensitivity profiles of M. furfur isolates according to the context of the patient. High MIC of antifungals like fluconazole, commonly used for treating pathologies caused by Malassezia, were identified.

Introducción. Malassezia es un género de levaduras lipofílicas que dependen de los lípidos y hacen parte de la microbiota de la piel de humanos y otros animales. No obstante, debido a procesos de disbiosis u otros factores en el huésped, esta levadura puede llegar a causar diferentes enfermedades: desde cutáneas (como dermatitis seborreica) hasta fungemias. Se han reportado aislamientos de Malassezia furfur en pacientes positivos para HIV, con lesiones cutáneas o sin ellas. Por su carácter oportunista y sensibilidad variable a los compuestos antifúngicos, es relevante conocer los perfiles de sensibilidad. Objetivo. Determinar la sensibilidad a diferentes antifúngicos de aislamientos clínicos de M. furfur obtenidos de pacientes positivos o negativos para HIV, con dermatitis seborreica o sin ella. Materiales y métodos. La sensibilidad de los aislamientos a itraconazol, voriconazol, fluconazol y anfotericina B, se determinó mediante dos técnicas: microdilución en caldo según el protocolo M27-A3 del Clinical & Laboratory Standards Institute (CLSI), con modificaciones, y pruebas en agar mediante Etest®. Resultados. Los aislamientos obtenidos de pacientes con HIV mostraron aumento de la concentración inhibitoria mínima a fluconazol, voriconazol y anfotericina B, en comparación con los de pacientes sin HIV. Por otro lado, al evaluar la mayoría de los aislamientos, el itraconazol fue el antifúngico con la menor concentración inhibitoria mínima. Conclusión. Se evidencian diferencias en los perfiles de sensibilidad de los aislamientos de M. furfur, según el contexto del paciente, y elevadas concentraciones inhibitorias mínimas de antifúngicos como el fluconazol, usados comúnmente para el tratamiento de las enfermedades causadas por Malassezia spp.

High levels of antimicrobial resistance in Escherichia coli and Salmonella from poultry in Ecuador / Niveles elevados de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella en aves de corral en Ecuador / Altos níveis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella de aves de criação no Equador

ABSTRACT Objective. To describe antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli and Salmonella spp. isolated from chicken carcasses and the antimicrobials commonly used in animals in Ecuador and provide information on antimicrobial resistance patterns for implementing evidence-based corrective measures. Methods. Meat samples were collected from chicken carcasses in 199 slaughterhouses across Ecuador as part of a national pilot study for monitoring antimicrobial resistance in agricultural sources in 2019. Samples were tested for E. coli and Salmonella spp. Sensitivity to 10 critically important and three highly important antimicrobials (from a human health perspective) was assessed. The country report submitted to the World Organization for Animal Health was accessed to extract the quantity of antimicrobials produced or imported for use in animals. Results. Of 383 samples, E. coli was isolated from 148 (39%) and Salmonella spp. from 20 (5%) samples. Ninety percent of the isolates were resistant to at least one critically important antimicrobial. Resistance was highest to erythromycin (E. coli 76%; Salmonella spp. 85%) and tetracycline (E. coli 71%; Salmonella spp. 90%). Critically or highly important antimicrobials (colistin, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole) formed the bulk (87%) of antimicrobials used in animals as per the World Organization for Animal Health report. Conclusions. High prevalence of antimicrobial resistance in poultry in Ecuador calls for the development of guidelines and regulations on the use of antimicrobials and for engagement with livestock producers. The existing surveillance system needs to be strengthened to improve the monitoring of antimicrobial use and evolving resistance patterns.

RESUMEN Objetivo. Describir los perfiles de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella spp. aisladas en carne de pollo y los antimicrobianos comúnmente empleados en animales en Ecuador, así como proporcionar información sobre los patrones de resistencia a los antimicrobianos para poner en marcha medidas correctivas basadas en la evidencia. Métodos. Se recogieron muestras de carne de pollo en 199 mataderos de todo Ecuador en el marco de un estudio piloto nacional para monitorear la resistencia a los antimicrobianos en fuentes agrícolas en el 2019. Se analizaron las muestras en busca de E. coli y Salmonella spp. Se evaluó la sensibilidad a diez antimicrobianos de importancia crítica y tres muy importantes (para la salud humana). Se accedió al informe de país presentado ante la Organización Mundial de Sanidad Animal para obtener la cantidad de antimicrobianos producidos o importados para su uso en animales. Resultados. De 383 muestras, se aisló E. coli en 148 (39%) y Salmonella spp. en 20 (5%). En total, 90% de las cepas aisladas fueron resistentes a al menos un antimicrobiano de importancia crítica. Hubo una mayor resistencia a la eritromicina (E. coli: 76%; Salmonella spp.: 85%) y a la tetraciclina (E. coli: 71%; Salmonella spp.: 90%). Los antimicrobianos de importancia crítica o muy importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprima/sulfametoxazol) constituyeron la mayor parte (87%) de los antimicrobianos empleados en animales según el informe de la Organización Mundial de Sanidad Animal. Conclusiones. Debido a la alta prevalencia de la resistencia a los antimicrobianos en las aves de corral en Ecuador, son imprescindibles la elaboración de directrices y regulaciones sobre el uso de antimicrobianos y el compromiso con los productores pecuarios. Es necesario fortalecer el sistema de vigilancia existente para mejorar el seguimiento del uso de antimicrobianos y de la evolución de los patrones de resistencia.

RESUMO Objetivo. Descrever perfis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella spp. isoladas de carcaças de frango e os antimicrobianos comumente usados em animais no Equador e fornecer informações sobre padrões de resistência aos antimicrobianos para implementar medidas corretivas baseadas em evidências. Métodos. Foram coletadas amostras de carne de carcaças de frango em 199 abatedouros em todo o Equador como parte de um estudo piloto nacional para monitorar a resistência aos antimicrobianos de origem agrícola em 2019. Foram testadas amostras de E. coli e Salmonella spp. Foi avaliada a sensibilidade a 10 agentes antimicrobianos de importância crítica e três agentes antimicrobianos muito importantes (do ponto de vista da saúde humana). O relatório do país apresentado à Organização Mundial de Saúde Animal foi acessado para extrair a quantidade de antimicrobianos produzidos ou importados para uso em animais. Resultados. De 383 amostras, E. coli foi isolada em 148 (39%) e Salmonella spp. em 20 (5%). Noventa por cento dos isolados foram resistentes a pelo menos um antimicrobiano de importância crítica. A resistência foi maior à eritromicina (E. coli, 76%; Salmonella spp., 85%) e à tetraciclina (E. coli, 71%; Salmonella spp., 90%). Antimicrobianos de importância crítica ou muito importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprim/sulfametoxazol) responderam pela maior parte (87%) dos antimicrobianos utilizados em animais, conforme o relatório da Organização Mundial de Saúde Animal. Conclusões. A alta prevalência de resistência aos antimicrobianos na avicultura no Equador exige o desenvolvimento de diretrizes e regulamentos sobre o uso de antimicrobianos e o envolvimento com os produtores de gado e avícolas. O sistema de vigilância existente precisa ser reforçado para melhorar o monitoramento do uso de antimicrobianos e a evolução dos padrões de resistência.

Susceptibilidad antimicrobiana de Streptococcus agalactiae en un hospital materno-infantil de Lima, Perú. 2015-2020

Objetivo : Determinar la susceptibilidad antimicrobiana de cepas de Streptococcus agalactiae (EGB) aisladas entre 2015-2020 en un hospital materno-infantil. Material y métodos : Estudio descriptivo realizado entre 2015 y 2020. La identificación y susceptibilidad antimicrobiana se determinaron por el sistema automatizado Vitek® 2. La base de datos obtenida fue transferida al programa WHONET versión 5.6. Se incluyeron 506 aislamientos de EGB. Resultados : 500 (98,8%) fueron en mujeres. La edad media fue de 31,9 ± 11,8 años. Todos fueron sensibles a penicilina, ampicilina y vancomicina, la resistencia a eritromicina, clindamicina y levofloxacino fue de 38,5%, 37,4% y 28%, respectivamente, mostrando un pico de resistencia en 2018. Conclusión : Se observó un incremento en la resistencia de EGB a los antimicrobianos, especialmente el año 2018.

SUMMARY Objective : To determine the antimicrobial susceptibility of S. agalactiae (SA) strains isolated from 2015-2020 in a maternal-infant hospital in Lima, Peru. Methods : A descriptive study was carried-out from 2015 to 2020. Identification and susceptibility were performed using Vitek®2. Data base was transferred to the WHONET version 5.6 program; 506 isolates were analyzed. Results: 500 (98.8%) were females; mean age was 31.9 ± 11.8 years. All strains were susceptible to penicillin, ampicillin and vancomycin. Resistance to erythromycin, clindamycin and levofloxacin were 38.5%, 37.4% and 28%, respectively, showing the highest value in 2018. Conclusions : An increase in resistance of SA to antimicrobials was observed, especially in 2018.

Infección del tracto urinario por enterobacterias en pacientes del laboratorio San José- Azogues / Enterobacteriaceae infection of the urinary tract in patients of the San José laboratory ­ Azogues / Infecção por Enterobacteriaceae do trato urinário em pacientes do laboratório "San José" - Azogues

La infección del tracto urinario es un proceso inflamatorio de los órganos involucrados, ocasionados por diferentes tipos de microorganismos, especialmente enterobacterias. OBJETIVO: el propósito del presente artículo es conocer la frecuencia de ITU con respecto a género, edad y de ello la presencia bacteriana y su perfil de resistencia en pacientes que acuden al laboratorio San José de la ciudad de Azogues-Ecuador. MATERIALES Y METODOS: se aplicó un estudio de tipo descriptivo de corte transversal, documental - secundario; en pacientes de ambos sexos y diferentes rangos de edad. La muestra final de aislados positivos fue de 210 pacientes, los datos obtenidos fueron procesados en el Software SPSS versión 25.0 para su tabulación y análisis. RESULTADOS: se determinó un mayor porcentaje de aislados positivos en mujeres con 93,7 %. El grupo etario con más afección es la adultez con un 50,5 %, seguido de adultos mayores y jóvenes con un 21,4 % y el 11 % respectivamente. El agente etiológico con mayor incidencia fue Escherichia Coli con un 70,95 % con una resistencia a SXT el porcentaje restante corresponde a Providencia spp, Klebsiella spp, Enterobacter spp y Proteus spp. La opción terapéutica para las enterobacterias fue fosfomicina, amoxicilina + clavulánico y nitrofurantoína. COCLUSION: el estudio viabilizó la obtención de resultados reales al respecto del ITU, confirmado la presencia de Escherichia coli como agente etiológico principal siendo su prevalencia en mujeres.

Urinary tract infection is an inflammatory process of the organs involved, caused by different types of microorganisms, especially enterobacteria. OBJECTIVE: the purpose of this article is to know the frequency of UTI with respect to gender, age and bacterial presence and their resistance profile in patients attending the San José laboratory in the city of Azogues-Ecuador. MATERIALS AND METHODS: a descriptive, cross-sectional, documentary-secondary study was applied in patients of both sexes and different age ranges. The final sample of positive isolates was 210 patients, the data obtained were processed in SPSS software version 25.0 for tabulation and analysis. RESULTS: a higher percentage of positive isolates was determined in women with 93.7%. The age group most affected was adulthood with 50.5 %, followed by the elderly and young adults with 21.4 % and 11 %, respectively. The etiological agent with the highest incidence was Escherichia coli with 70.95 % with resistance to SXT, the remaining percentage corresponded to Providencia spp, Klebsiella spp, Enterobacter spp and Proteus spp. The therapeutic option for enterobacteria was fosfomycin, amoxicillin + clavulanic acid and nitrofurantoin. CONCLUSION: the study made it feasible to obtain real results regarding UTI, confirming the presence of Escherichia coli as the main etiological agent and its prevalence in women

A infecção do trato urinário é um processo inflamatório dos órgãos envolvidos, causado por diferentes tipos de microorganismos, especialmente enterobactérias. OBJETIVO: o objetivo deste artigo é determinar a freqüência de UTI com relação ao sexo, idade e presença de bactérias e seu perfil de resistência em pacientes que freqüentam o laboratório San José, na cidade de Azogues-Equador. MATERIAIS E MÉTODOS: foi realizado um estudo descritivo, transversal e documental-secundário em pacientes de ambos os sexos e diferentes faixas etárias. A amostra final de isolados positivos foi de 210 pacientes, os dados obtidos foram processados no software SPSS versão 25.0 para tabulação e análise. RESULTADOS: uma porcentagem maior de isolados positivos foi encontrada em mulheres com 93,7%. A faixa etária mais afetada foi a adulta com 50,5%, seguida por adultos mais velhos e mais jovens com 21,4% e 11% respectivamente. O agente etiológico com maior incidência foi Escherichia coli com 70,95% de resistência ao SXT. A porcentagem restante corresponde a Providencia spp, Klebsiella spp, Enterobacter spp e Proteus spp. A opção terapêutica para enterobactérias foi fosfomicina, amoxicilina mais ácido clavulânico e nitrofurantoína. CONCLUSÃO: o estudo tornou viável a obtenção de resultados reais em relação à UTI, confirmando a presença da Escherichia coli como o principal agente etiológico e sua prevalência nas mulheres.

Caracterización molecular de genes de virulencia (lmb, bca y rib) y de resistencia a macrólidos (ermB, ermTR y mefA) en aislamientos clínicos de Streptococcus agalactiae / Molecular characterization of virulence (lmb, bca and rib) and macrolid resistance genes (ermB, ermTR and mefA) in clinical isolates of Streptococcus agalactiae

RESUMEN El objetivo del estudio fue identificar molecularmente los genes de virulencia y resistencia a macrólidos en aislamientos clínicos de Streptococcus agalactiae (EGB), recuperados en 2019 a partir de secreción vaginal (n=9) y orina (n=22), en dos establecimientos de salud de Lima. La identificación y susceptibilidad antimicrobiana se determinaron por el sistema automatizado Vitek® 2, se confirmó la identificación fenotípicamente; la resistencia a macrólidos por el método D-test; la identificación de genes de virulencia (lmb, bca y rib) y de resistencia a macrólidos (ermB, ermTR y mefA) por reacción en cadena de la polimerasa (PCR). El fenotipo y genotipo de resistencia a macrólidos predominante fue cMLSb (12/31) y ermB (11/31), y el gen de virulencia más frecuente fue lmb (23/31). Todos fueron sensibles a penicilina, ampicilina y vancomicina. Estos hallazgos muestran la necesidad de implementar estudios de epidemiología molecular que permitan un adecuado conocimiento y seguimiento de EGB en el Perú.

ABSTRACT The aim of the study was to molecularly identify virulence and macrolide resistance genes in clinical isolates of Streptococcus agalactiae (GBS), recovered in 2019 from vaginal discharge (n=9) and urine (n=22), from two health facilities in Lima. Identification and antimicrobial susceptibility were determined by the Vitek® 2 automated system, identification was confirmed phenotypically; macrolide resistance was determined by the D-test method. Identification of virulence genes (lmb, bca and rib) and macrolide resistance genes (ermB, ermTR and mefA) was carried out by polymerase chain reaction (PCR). The predominant macrolide resistance phenotype and genotype were cMLSb (12/31) and ermB (11/31); the most frequent virulence gene was lmb (23/31). All were sensitive to penicillin, ampicillin and vancomycin. These findings show the need to implement molecular epidemiology studies that allow adequate knowledge and follow-up of GBS in Peru.

Prevalencia de resistencia de bacteria aisladas en hemocultivos, en un hospital universitario de Colombia / Prevalence of bacterial resistance isolated in hemocultives, in a university hospital of Colombia

Resumen Objetivo. Describir la frecuencia de los microorganismos y la resistencia antibiótica de bacterias aisladas en hemocultivos de pacientes con Bacteremia, en un hospital universitario de Colombia. Métodos. Se desarrolló un estudio observacional, descriptivo y de corte transversal, en individuos mayores de 18 años, en donde se describió los hemocultivos positivos, aislados en todos los servicios del Hospital Universitario del Caribe. Resultados. De los 211 hemocultivos analizados, el 53,1% fueron hombres. Los microorganismos Gram positivos corresponden a 49,8%, con una alta frecuencia de S. aureus en un 16,1%. De los microorganismos Gram negativos fue aislado E.coli en un 18%. La resistencia a vancomicina se estableció en 4,4%. La K. pneumoniae presentó una resistencia a meropenem en un 15,3% de los casos. E.coli, P. aeruginosa y E.cloacae son sensibles a carbapénicos. Así en nuestro estudio las bacterias más frecuentemente aisladas en los hemocultivos fueron predominantemente Gram negativos, con resistencia a carbapénicos para algunas cepas de K. Pneumoniae.

Abstract Objective. To describe the frequency of microorganisms and the antibiotic resistance of isolated bacteria in blood cultures of patients with bacteremia, in a university hospital in Colombia. Methods. An observational, descriptive, and cross-sectional study was developed in individuals older than 18 years, where the positive blood cultures were described, isolated in all the services of the University Hospital of the Caribbean. Results. Of the 211 blood cultures analyzed, 53.1% were men. The Gram-positive microorganisms correspond to 49.8%, with a high frequency of S. aureus in 16.1%. Of the Gram negative microorganisms, E.coli was isolated by 18%. Vancomycin resistance was established at 4.4%. K. pneumoniae showed resistance to meropenem in 15.3% of cases. E.coli, P. aeruginosa and E. cloacae are sensitive to carbapenes. Thus, in our study, the bacteria most frequently isolated in the blood cultures were predominantly Gram negative, with resistance to carbapenes for some strains of K. pneumoniae.

Marcadores hematológicos y bioquímicos para el diagnóstico precoz de bacteriemiascausadas por Enterobacteriaceae resistentes a los carbapenémicos / Haematological and biochemical markers for the early diagnosis of bacteremias caused bycarbapenem-resistant Enterobacteriaceae

INTRODUCCIÓN. Las bacteriemias causadas por Enterobacteriaceae resistentes a carbapenémicos se asocian con altas tasas de mortalidad a diferencia de las bacteriemias causadas por Enterobacteriaceae sensibles a carbapenémicos. Los hallazgos clínicos y de laboratorio son importantes para determinar los esquemas terapéuticos y su pronóstico; su diagnóstico precoz resulta esencial para un manejo adecuado. OBJETIVO. Relacionar valores de marcadores sanguíneos y bioquímicos en bacteriemias causadas por Enterobacteriaceae resistentes a carbapenémicos. MATERIALES Y MÉTODOS. Estudio analítico transversal. Población de 427 y muestra de 224 datos de hemocultivos positivos para Enterobacteriaceae de pacientes atendidos en el Hospital de Especialidades Carlos Andrade Marín en el periodo mayo 2016 a julio 2018. Criterios de inclusión: i) al menos un hemocultivo positivo; ii) recuperación del aislado de CRE o CSE y iii) recolección simultanea de muestras de sangre y pruebas de laboratorio. Criterios de exclusión: i) bacteriemias polimicrobianas; ii) valores fuera de rango y iii) reportes sin valores numéricos. El análisis de datos se realizó mediante el programa estadístico International Business Machines Statistical Package for the Social Sciences versión 24.0. RESULTADOS. Se demostró que el recuento de leucocitos [OR 1,21 (95% IC: 1,03-1,43)], el recuento de plaquetas [OR 1,65 (95% IC: 1,37-1,98)] y el tiempo parcial de tromboplastina [OR 1,29 (95% IC: 1,04-1,60)] fueron buenas variables predictoras independientes, mediante análisis de regresión logística multivariante. CONCLUSIÓN. La trombocitopenia y el tiempo parcial de tromboplastina prolongado se asociaron con bacteremia causada por Enterobacteriaceae resistentes a carbapenémicos.

INTRODUCTION. Bacteremias caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae are associated with high mortality rates in contrast to bacteremias caused by carbapenem-sensitive Enterobacteriaceae. Clinical and laboratory findings are important in determining therapeutic regimens and prognosis; early diagnosis is essential for appropriate management. OBJECTIVE. To relate blood and biochemical marker values in bacteremia caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae. MATERIALS AND METHODS. Cross-sectional analytical study. Population of 427 and sample of 224 blood culture data positive for Enterobacteriaceae from patients attended at the Carlos Andrade Marín Specialties Hospital in the period May 2016 to July 2018. Inclusion criteria: i) at least one positive blood culture; ii) recovery of CRE or CSE isolate and iii) simultaneous collection of blood samples and laboratory tests. Exclusion criteria: i) polymicrobial bacteremia; ii) out-of-range values and iii) reports without numerical values. Data analysis was performed using the statistical program International Business Machines Statistical Package for the Social Sciences version 24.0. RESULTS. Leukocyte count [OR 1.21 (95% CI: 1.03-1.43)], platelet count [OR 1.65 (95% CI: 1.37- 1.98)] and partial thromboplastin time [OR 1.29 (95% CI: 1.04-1.60)] were shown to be good independent predictor variables, by multivariate logistic regression analysis. CONCLUSION. Thrombocytopenia and prolonged partial thromboplastin time were associated with bacteremia caused by carbapenem-resistant Enterobacteriaceae.

Resistencia de Cepas de Staphylococcus aureus Aisladas de la Mucosa Oral de una Población Joven Peruana

RESUMEN: Staphylococcus aureus es un patógeno importante responsable de una variedad de enfermedades infecciosas. La emergencia de cepas resistentes a la meticilina es un tema preocupante. Existen escasos estudios que hayan reportado la resistencia de cepas aisladas de la cavidad bucal. Determinar la sensibilidad antimicrobiana de cepas de Staphylococcus aureus aisladas de mucosa bucal de portadores asintomáticos jóvenes peruanos. Se incluyeron 64 individuos a quienes se tomaron muestras de mucosa oral, mucosa nasal y de manos. Las muestras fueron cultivadas en agar manitol salado. La prueba coagulasa fue empleada para confirmar la presencia de Staphylococcus aureus. Luego se realizó el antibiograma usando el método de Kirby-Bauer. La prevalencia de colonias positivas de S. aureus provenientes de la mucosa oral, mucosa nasal y de la palma de la mano fue 7,8 %, 15,6 % y 50,0 %, respectivamente. En todas las muestras, se observaron una prevalencia de sensibilidad menor de 40 % y 11 % a la eritromicina y penicilina, respectivamente. Las colonias de la mucosa oral mostraron resistencia a la penicilina. En todas las muestras, se observó una prevalencia de sensibilidad ³ 60% en amoxicilina/ácido clavulánico, co-trimoxazol, gentamicina, oxacilina, ciprofloxacino, vancomicina y ampicilina/sulbactam. Se encontró resistencia a vancomicina en un 10 - 20 % de todas las muestras. Se encontró una alta prevalencia en la sensibilidad a amoxicilina/ácido clavulánico, gentamicina, cotrimoxazol, oxacilina, ciprofloxacino y ampicilina/sulbactam. Se encontró un elevado porcentaje de resistencia a la vancomicina en muestras de mucosa oral en comparación a otros estudios.

ABSTRACT: Staphylococcus aureus is an important pathogen responsible for a variety of infectious diseases. The increase of resistant strains is an issue of concern. There are very few studies reporting the resistant strains isolated from oral cavity. Aim: To determine the antimicrobial susceptibility of Staphylococcus aureus isolated from oral mucosa of Peruvian young healthy carriers. The study included 64 healthy individuals whose oral mucosa, nasal mucosa and hand swabs were collected and seeded in salt mannitol agar for primary isolation. Then, coagulase test was performed to confirm the presence of Staphylococcus aureus. After that, colonies of Staphylococcus aureus underwent antibiogram by using the Kirby Bauer method. The prevalence of Staphylococcus aureus positive strains isolated from oral mucosa, nasal mucosa, and hand, was 7.8 %, 15.6 %, 50.0 %, respectively. There was less than 40 % and 11 % of prevalence of susceptibility to erythromycin and penicillin, respectively, in the three studied samples. There was equal or more than 60% of prevalence of susceptibility to amoxicillin/clavulanic acid, cotrimoxazole, gentamicin, oxacillin, ciprofloxacin, vancomycin and ampicillin/sulbactam in all the studied samples. Vancomycin resistance was found in 10 - 20 % of all samples. A high prevalence in susceptibility to amoxicillin/ clavulanic acid, gentamicin, co-trimoxazole, oxacillin, ciprofloxacin, vancomycin and ampicillin /sulbactam in healthy carriers was found. Vancomycin resistance percentage is higher than previous reports.

Prevalencia de infección del tracto urinario y perfil de susceptibilidad antimicrobiana en Enterobacterias

Resumen Las Infecciones del Tracto Urinario (ITU), constituyen uno de los principales motivos de consulta en el ámbito de atención primaria, debido al aumento de la resistencia antibacteriana. Objetivo . Caracterizar la prevalencia de infección del tracto urinario y el perfil de susceptibilidad antimicrobiana in vitro en Enterobacterias en los pacientes de la provincia de Santa Elena - Ecuador. Método . Esta investigación fue descriptiva de diseño documental. La población fue de 827 registros de urocultivos, recopilados de la base de datos del laboratorio de microbiología del Centro de Especialidades IESS La Libertad, en el período comprendido desde agosto 2019 hasta marzo de 2020. Los datos fueron procesados mediante estadística descriptiva, análisis de frecuencia y chi cuadrado. Resultados . De este estudio indican que la prevalencia de ITU fue 22,1%; los principales agentes etiológicos fueron: E. coli (76,0%), Klebsiella oxytoca (6,5%), Klebsiella pneumoniae (5,8%) y Proteus mirabilis (3,9%). La ITU y la infección por E. coli fueron estadísticamente mayores en mujeres y adultos mayores. La mayor frecuencia de resistencia de E. coli fue para ácido nalidíxico (81,2%), ampicilina (79,9%), ciprofloxacina (72,6%) y sulfametoxazol trimetoprima (61,5%); en Klebsiella oxytoca fue ampicilina (80,0%), sulfametoxazol trimetoprima (70,0%), ácido nalidíxico (60,0%) y ciprofloxacina (40,0%). Mientras que en Klebsiella pneumoniae se halló una resistencia del (100%) para ampicilina y cefalotina, amoxicilina y ácido clavulánico (66,7%), ciprofloxacina (55,6%), ácido nalidíxico (44,4%), meropenem e imipenem (11,1%). Conclusiones. La E. coli continúa siendo el microorganismo más frecuente en ITU. El tratamiento empírico de ITU debería incluir amikacina, nitrofurantoina y piperacilina tazobactam.

Abstract Urinary Tract Infections (UTI) are one of the main reasons for consultation in the primary care setting, due to the increase in antibacterial resistance. Objective . To characterize the prevalence of urinary tract infection and the in vitro antimicrobial susceptibility profile of Enterobacteriaceae in patients in the province of Santa Elena - Ecuador. Method. This was a descriptive research of documentary design. The population was 827 urine culture records, collected from the database of the microbiology laboratory of the Centro de Especialidades IESS La Libertad, in the period from August 2019 to March 2020. The data were processed using descriptive statistics, frequency analysis and chi-square. Results . From this study indicate that the prevalence of UTI was 22.1%; the main etiological agents were: E. coli (76.0%), Klebsiella oxytoca (6.5%), Klebsiella pneumoniae (5.8%) and Proteus mirabilis (3.9%). UTI and E. coli infection were statistically higher in women and older adults. The highest frequency of E. coli resistance was for nalidixic acid (81.2%), ampicillin (79.9%), ciprofloxacin (72.6%) and trimethoprim sulfamethoxazole (61.5%); in Klebsiella oxytoca it was ampicillin (80.0%), trimethoprim sulfamethoxazole (70.0%), nalidixic acid (60.0%) and ciprofloxacin (40.0%). While in Klebsiella pneumoniae, 100% resistance was found for ampicillin and cephalothin, amoxicillin and clavulanic acid (66.7%), ciprofloxacin (55.6%), nalidixic acid (44.4%), meropenem and imipenem (11.1%). Conclusions . E. coli continues to be the most frequent microorganism in UTI. Empirical treatment of UTI should include amikacin, nitrofurantoin and piperacillin tazobactam.

Resumo As infecções do trato urinário (IU) são um dos principais motivos de consulta no âmbito dos cuidados primários, devido ao aumento da resistência antibacteriana. Objetivo . Caracterizar a prevalência da infecção do trato urinário e o perfil de suscetibilidade antimicrobiana in vitro de Enterobacteriaceae em pacientes da província de Santa Elena - Equador. Método . Esta foi uma pesquisa descritiva do projeto documental. A população era de 827 registros de cultura de urina, coletados do banco de dados do laboratório de microbiologia do Centro de Especialidades IESS La Libertad, no período de agosto de 2019 a março de 2020. Os dados foram processados utilizando estatísticas descritivas, análise de freqüência e qui-quadrado. Resultados. Deste estudo indicam que a prevalência de UTI foi de 22,1%; os principais agentes etiológicos foram: E. coli (76,0%), Klebsiella oxytoca (6,5%), Klebsiella pneumoniae (5,8%) e Proteus mirabilis (3,9%). A infecção por UTI e E. coli foi estatisticamente maior nas mulheres e nos adultos mais velhos. A maior freqüência de resistência do E. coli foi para o ácido nalidíxico (81,2%), ampicilina (79,9%), ciprofloxacina (72,6%) e trimetoprim sulfametoxazol (61,5%); em Klebsiella oxytoca era ampicilina (80,0%), trimetoprim sulfametoxazol (70,0%), ácido nalidíxico (60,0%) e ciprofloxacina (40,0%). Enquanto em Klebsiella pneumoniae, foi encontrada 100% de resistência para ampicilina e cefalotina, amoxicilina e ácido clavulânico (66,7%), ciprofloxacina (55,6%), ácido nalidíxico (44,4%), meropenem e imipenem (11,1%). Conclusões . A E. coli continua sendo o microorganismo mais freqüente na UTI. O tratamento empírico da UTI deve incluir amikacina, nitrofurantoína e piperacilina tazobactam.

Frecuencia de (BLEE) (AmpC) y CARBAPENEMASAS en muestras de urocultivo, en cepas de Escherichia Coli de origen comunitario

Resumen La Escherichia coli (E. coli) forma parte del grupo de las principales enterobacterias, que por su alta prevalencia y capacidad de generar resistencia a ciertos antimicrobianos es la causante de varios procesos infecciosos de origen comunitario sobre todo infecciones del tracto urinario. El mecanismo de defensa de estas bacterias es la activación enzimática a través de las Betalactamas de tipo BLEE, AmpC y CARBAPENEMASAS. Materiales y Métodos. Diseño documental transversal, con un enfoque cuantitativo, la población estuvo constituida por 671 informes de urocultivo procesadas en el período de enero - abril de 2020 en el Laboratorio Clínico Neolab de la ciudad de Cuenca en el Ecuador. Resultados . El 96,4% de las muestras son de pacientes femenino y un 3.6% al género masculino, el promedio de edad, el estudio tuvo mayor prevalencia en pacientes de 40 años de edad. El 7.62% de las muestras resultaron BLEE positivas, 0.13% AmpC y el 0% CARBAPENEMASAS. Los antibióticos con un mayor índice de efectividad para tratar la E.coli productora de BLEE en urocultivos fueron la Nitrofurantoína, la Gentamicina y Fosfomicina con índices de efectividad del 87.93%, 79,31% y 70,68% respectivamente. Sin embargo los antimicrobianos como Ampicilina presentaron una resistencia del 100% y Trimethoprim sulfa metoxazol del 72.41%. Conclusión . La detección de frecuencia de enzimas BLEE, AmpC y Carbapenemasas, orienta a un tratamiento terapéutico adecuado. Los pacientes con bacterias productoras de BLEE, tienen un alto índice de mortalidad al ser tratados con antimicrobianos que las bacterias presentan una resistencia alta.

Abstract Escherichia coli (E. coli) is part of the group of the main Enterobacteriaceae, which due to its high prevalence and capacity to generate resistance to certain antimicrobials is the cause of several infectious processes of community origin, especially urinary tract infections. The defense mechanism of these bacteria is enzymatic activation through ESBL-type Betalactams, AmpC and CARBAPENEMASES. Materials and Methods. Cross-sectional documentary design, with a quantitative approach, the population consisted of 671 uroculture reports processed in the period January - April 2020 at the Neolab Clinical Laboratory in the city of Cuenca in Ecuador. Results. 96.4% of the samples are from female patients and 3.6% from male gender, the average age, the study had a higher prevalence in 40-year-old patients. 7.62% of the samples were positive ESBL, 0.13% AmpC and 0% CARBAPENEMASES. The antibiotics with the highest effectiveness rate for treating ESBL-producing E.coli in urine cultures were Nitrofurantoin, Gentamicin, and Fosfomycin, with effectiveness rates of 87.93%, 79.31%, and 70.68%, respectively. However, antimicrobials such as Ampicillin showed a resistance of 100% and Trimethoprim sulfamethoxazole of 72.41%. Conclusion. The frequency detection of ESBL, AmpC and Carbapenemases enzymes guides an adequate therapeutic treatment. Patients with ESBL-producing bacteria have a high mortality rate when treated with antimicrobials that the bacteria have high resistance.

Resumo Escherichia coli (E. coli) faz parte do grupo das principais enterobactérias, que por sua alta prevalência e capacidade de gerar resistência a certos antimicrobianos é causa de diversos processos infecciosos de origem comunitária, principalmente infecções do trato urinário. O mecanismo de defesa dessas bactérias é a ativação enzimática por meio de Betalactamas do tipo ESBL, AmpC e CARBAPENEMASES. Materiais e Métodos. Desenho documental transversal, com abordagem quantitativa, a população foi constituída por 671 laudos de urocultura processados no período de janeiro a abril de 2020 no Laboratório Clínico Neolab da cidade de Cuenca no Equador. Resultados. 96,4% das amostras são do sexo feminino e 3,6% do sexo masculino, idade média, o estudo teve maior prevalência em pacientes com 40 anos de idade. 7,62% das amostras foram ESBL positivas, 0,13% AmpC e 0% CARBAPENEMASES. Os antibióticos com maior taxa de eficácia para o tratamento de E. coli produtoras de ESBL em urocultura foram nitrofurantoína, gentamicina e fosfomicina, com taxas de eficácia de 87,93%, 79,31% e 70,68%, respectivamente. No entanto, antimicrobianos como a Ampicilina apresentaram resistência de 100% e Trimetoprim sulfametoxazol de 72,41%. Conclusão. A detecção da frequência das enzimas ESBL, AmpC e Carbapenemases orienta um tratamento terapêutico adequado. Pacientes com bactérias produtoras de ESBL apresentam alta taxa de mortalidade quando tratados com antimicrobianos que as bactérias apresentam alta resistência.

Resistencia a antibióticos de relevancia clínica en un hospital de Corrientes / Resistance to antibiotics of clinical relevance in a hospital of Corrientes city

Resumen Las bacterias productoras de carbapenemasas están involucradas en infecciones y colonizaciones y se asocian a elevada morbimortalidad. Su identificación facilita el diseño y la implementación de intervenciones dirigidas a reducir el riesgo de infecciones y óbitos. El objetivo de este estudio fue determinar la prevalencia de microorganismos productores de carbapenemasas en el principal hospital público de la ciudad de Corrientes, Argentina, y determinar sus perfiles de susceptibilidad a antibióticos comúnmente usados en la práctica clínica. Fueron incluidos 674 muestras clínicas provenientes del mismo número de adultos de las diferentes unidades de internación del Hospital Escuela Gral. José Francisco de San Martín durante el período septiembre-diciembre 2018. La identificación de las bacterias se realizó mediante pruebas bioquímicas manua les y la susceptibilidad a los antimicrobianos se evaluó según las recomendaciones del Clinical and Laboratory Standars Institute. Fueron identificadas 115 bacterias productoras de carbapenemasas de tipo KPC (90, 78%), OXA-ACI (24, 21%) y OXA-163 (~1%). De los 56 (49%) microorganismos involucrados en infecciones, la mayoría de las del tipo KPC (n=32; 57%) mostró sensibilidad solo a amikacina (27/32; 84%), mientras que la mayoría de las del tipo OXA-ACI (n=24; 43%) solo frente a minociclina (17/24; 71%) y colistina (19/24; 79%). En todas las unidades de hospitalización investigadas se comprobó la presencia de microorganismos productores de carbapenemasas y alta frecuencia de resistencia a antimicrobianos de uso habitual en la práctica clínica. Esta información es relevante para adecuar los esquemas terapéuticos y las medidas higiénico-sanitarias a la realidad local.

Abstract Carbapenemase-producing bacteria are involved in infections and colonizations and associated with high morbidity and mortality. Their identification facilitates the design and implementation of interventions aimed at reducing the risk of infections and deaths. The objective of this study was to determine the prevalence of carbapenemase-producing microorganisms in the main public hospital in the city of Corrientes, Argentina, and to determine their susceptibil ity to antibiotics commonly used in clinical practice. We analyzed 674 clinical samples from the same number of adults admitted to different inpatient units of the Hospital Escuela Gral. José Francisco de San Martín during the period September-December 2018. The bacterial identification was carried out through manual biochemical tests and the susceptibility to antimicrobials was evaluated according to the recommendations of the Clinical and Laboratory Standards Institute. We identified 115 carbapenemase-producing bacteria of the following types: KPC (90, 78%), OXA-ACI (24, 21%) and OXA-163 (~1%). Among the microorganisms involved in infections (n = 56; 49%), most of those of the KPC type (n = 32; 57%) showed sensitivity only against amikacin (27/32; 84%), while most of those of the OXA-ACI type ( 24; 43%) showed significant sensitivity only against minocycline (17/24; 71%) and colistin (n = 19/24; 79%). This study demonstrated the presence of carbapenemase-producing microorgan isms in all the investigated hospital units and a high frequency of resistance to antimicrobials commonly used in clinical practice. This information is relevant to adapt the therapeutic schemes and hygienic-sanitary measures to the local reality.

Susceptibilidad a la ciprofloxacina en Salmonella enterica serotipo Typhi, no multidrogorresistente, 2017 a 2020 / Susceptibility to ciprofloxacin in Salmonella enterica serotype Typhi, no multidrug resistant, 2017 to 2020

Introducción. Los patrones de susceptibilidad antimicrobiana de Salmonella enterica serotipo Typhi se han modificado globalmente durante las últimas tres décadas. Objetivo. Describir los patrones de susceptibilidad antimicrobiana de las cepas de Salmonella enterica Typhi, aisladas en El Salvador de enero 2017 a junio 2020. Metodología. Evaluación secundaria de las bases de datos del Laboratorio Nacional de Salud Pública, de los aislamientos de Salmonella enterica Typhi con sus respectivos antibiogramas, de muestras de pacientes que adolecieron de fiebre tifoidea en El Salvador, de enero 2017 a junio 2020. Resultados. 1406 aislamientos de Salmonella enterica Typhi fueron reportados. El 100 % de los aislamientos analizados presentó susceptibilidad a la ceftriaxona y a la azitromicina. El 99,9 % de los aislamientos analizados presentó susceptibilidad a la ampicilina, al cloranfenicol, a la tetraciclina y al trimetoprim-sulfametoxazol. Para ciprofloxacina, se detectó susceptibilidad en el 8,5% de las cepas analizadas, susceptibilidad intermedia en el 91,5% y resistencia en el 0,08 %. Conclusión. Los hallazgos son compatibles con lo reportado a nivel mundial: el desarrollo rápido de susceptibilidad intermedia o resistencia a la ciprofloxacina, una vez esta es adoptada como el tratamiento de elección para la fiebre tifoidea. En El Salvador, los antibióticos antes considerados como de primera línea contra Salmonella enterica Typhi, deben ser reciclados

Introduction. The antimicrobial susceptibility patterns of Salmonella enterica serotype Typhi have been modified globally for the past three decades. Target. Describe the antimicrobial susceptibility patterns of Salmonella enterica Typhi strains, isolated in El Salvador from January 2017 to June 2020. Methodology. Secondary assessment from the databases of the National Public Health Laboratory, of the isolates of Salmonella enterica Typhi with their respective antibiograms, of samples of patients who suffered from typhoid fever in El Salvador, from January 2017 to June 2020. Results. 1406 isolates of Salmonella enterica Typhi were reported. 100% of the isolations analyzed showed susceptibility to ceftriaxone and azithromycin. 99.9% of the isolates analyzed presented susceptibility to ampicillin, chloramphenicol, tetracycline, and trimethoprim-sulfamethoxazole. For ciprofloxacin, detected susceptibility in 8.5% of the strains analyzed, intermediate susceptibility in 91.5% and resistance in the 0.08%. Conclution. The findings are consistent with what has been reported worldwide: the rapid development of susceptibility intermediate or resistance to ciprofloxacin, once it is adopted as the treatment of choice for typhoid fever. In El Salvador, antibiotics previously considered first-line against Salmonella enterica Typhi, must be recycled

Evaluación de las características fisicoquímicas y de la actividad antimicrobiana del aceite del árbol de té contra Cutibacterium acnes (Propionibacterium acnes) ATCC 6919 / Evaluation of tea tree oil physicochemical features and its antimicrobial activity against Cutibacterium acnes (Propionibacterium acnes) ATCC 6919

Resumen: Introducción. El aceite del árbol de té es un aceite esencial reconocido por sus propiedades antimicrobianas. Objetivos. Evaluar la composición, características y efecto antimicrobiano del aceite al 2 % del árbol de té y su concentración inhibitoria mínima (CIM) contra Cutibacterium acnes (Propionibacterium acnes). Materiales y métodos. Se evaluó el quimiotipo en tres lotes diferentes de este aceite mediante cromatografía de gases, así como su actividad antimicrobiana en concentración al 2 % v/v y la CIM contra C. acnes mediante ensayo de difusión en agar (guía M11-A8 CLSI). Resultados. Los lotes evaluados presentaron los quimiotipos ajustados a la norma ISO 4730, lo que indicó la alta calidad del producto. Los lotes contenían de 30 a 40 % de terpinen-4-ol, compuesto que favorece la actividad antimicrobiana, la cual presentó en todos los lotes un efecto dependiente de la concentración contra C. acnes, con una inhibición del crecimiento microbiano en concentración al 2 % v/v en todas las pruebas. La concentración inhibitoria mínima fue de 0,25 % v/v. La actividad antimicrobiana del aceite del árbol de té contra este microorganismo ya ha sido reportada con una concentración inhibitoria mínima entre 0,05 y 1,25 % v/v, rango que cobija la obtenida en este estudio. Conclusiones. Los resultados evidenciaron la gran calidad de este producto y su capacidad como agente antibacteriano contra C. acnes. Se deben hacer estudios con otros aislamientos del microorganismo provenientes de pacientes con acné vulgar para confirmar su actividad general y la de cada uno de sus componentes.

Abstract: Introduction: Tea tree oil is an essential oil recognized for its antimicrobial properties. Objective: To evaluate the composition, features, and antimicrobial effect at 2% v/v, and its minimal inhibitory concentration (MIC) against Cutibacterium acnes (Propionibacterium acnes). Materials and methods: Three different batches of tea tree oil were evaluated. We characterized its chemotype by gas chromatography and its 2% v/v antimicrobial activity against C. acnes by agar diffusion assay (guide M11-A8 CLSI). Results: The three batches of oil had the chemotypes required by the ISO 4730 standard, which indicates that it is a high-quality product. Additionally, they had 30% to 40% of terpinen-4-ol, a compound that favors its antimicrobial activity. Antimicrobial activity against C. acnes for all batches had a concentration-dependent effect with microbial growth inhibitory activity in all assays at 2% v/v. The MIC obtained against C. acnes for all batches was 0.25% v/v. The antimicrobial activity of tea tree oil against this microorganism has been previously reported with a MIC between 0.05% and 1.25% v/v, a range that covers the one obtained in this study. Conclusion: These results show the high quality of the oil and its capacity as an antibacterial agent against C. acnes. New studies should be conducted to confirm its activity and that of its components in isolates of the microorganism from patients with acne vulgaris.

Actividad antimicrobiana de metabolitos secundarios de Aspergillus fumigatus sensu stricto sobre cepas clínicas de Staphylococcus aureus y Streptococcus pneumoniae / Antimicrobial activity of secondary metabolites of Aspergillus fumigatus sensu stricto on clinical strains of Staphylococcus aureus and Streptococcus pneumoniae

RESUMEN Introducción . La resistencia a los antibióticos de bacterias Gram positivas es un grave problema de salud pública donde algunas medidas paliativas pueden encontrarse en los principios antimicrobianos de hongos filamentosos. Objetivo . Evaluar la actividad antimicrobiana de metabolitos secundarios de un aislamiento clínico de Aspergillus fumigatus sobre cepas clínicas de Staphylococcus aureus y Streptococcus pneumoniae. Métodos . La fermentación líquida de A. fumigatus se realizó en un caldo líquido sulfato, papa y dextrosa, utilizando acetato de etilo para la extracción de metabolitos. Mediante la metodología de disco difusión se evaluó la actividad antimicrobiana considerada como un halo mayor de 6 mm. Resultados . Se obtuvo una media de 24,02 ± 2,51 mm y 23,62 ± 4,68 mm de halo de inhibición sobre Staphylococcus aureus sensible y resistente oxacilina, respectivamente. Para Streptococcus pneumoniae sensibles y no sensibles a penicilina las medias fueron de 25,82 ± 4,05 mm y 26,5 ± 5,39 mm, respectivamente. Conclusiones . El extracto crudo de A. fumigatus posee metabolitos secundarios de naturaleza alcaloide y esteroles insaturados con actividad antimicrobiana.

ABSTRACT Introduction . The antibiotic resistance of Gram positive bacteria is a serious public health problem where some palliative measures can be found in the antimicrobial principles of filamentous fungi. Objective. : To evaluate the antimicrobial activity of secondary metabolites of a clinical isolation of Aspergillus fumigatus on clinical strains of Staphylococcus aureus and Streptococcus pneumoniae. Methods . The liquid fermentation of A. fumigatus was carried out in a liquid broth sulfate, potato and dextrose; using ethyl acetate for the extraction of secondary metabolites. The antimicrobial activity considered as a halo greater than 6 mm was evaluated using the diffusion disk methodology. Results . A mean of 24,02 ± 2,51 mm and 23,62 ± 4,68 mm was obtained on sensitive and resistant Staphylococcus aureus, respectively. For Streptococcus pneumoniae sensitive and non-susceptible, the means were 25,82 ± 4,05 mm and 26,5 ± 5,39 mm, respectively. Conclusions . The crude extract of A. fumigatus has secondary metabolites of alkaloid nature and unsaturated sterols with antimicrobial activity.

Actividad antimicrobiana de Streptomyces sp. 6E3 aislado de concentrado de mineral* / Streptomyces sp. 6E3 antimicrobial activity isolated from mineral concentrate

RESUMEN El objetivo de este estudio fue determinar la actividad antimicrobiana de un cultivo de Streptomyces sp. 6E3 aislado de minerales frente a diferentes cepas patógenas, producir un extracto y estimar la concen tración mínima inhibitoria (CMI) de las fracciones contra Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM). La cepa Streptomyces sp. 6E3 mostró actividad antimicrobiana principalmente contra Staphy lococcus aureus (S. aureus). Cinco de las seis fracciones presentaron actividad antimicrobiana y la más efectiva dio una CMI de 0,88 ug/mL frente a S. aureus ATCC 33862, 0,44 ug/mL frente a S. aureus ATCC 43300 y 1,76 ug/mL frente a S. aureus cepa SARM. Streptomyces sp. 6E3 tiene un potencial antimicrobiano frente a cepas de S. aureus resistentes a meticilina y no resistentes, siendo de interés la realización de más estudios sobre sus metabolitos activos.

ABSTRACT The objectives of this study were to determine the antimicrobial activity of a culture of Streptomyces sp. 6E3 isolated from minerals against different pathogenic strains, to produce an extract and to estimate the minimum inhibitory concentration (MIC) of the fractions against methicillin-resistant Staphylococ cus aureus (MRSA). Streptomyces sp. 6E3 showed antimicrobial activity primarily against Staphylococcus aureus (S. aureus). Five of the six fractions presented antimicrobial activity and the most effective gave a MIC of 0.88 ug / mL against S. aureus ATCC 33862, 0.44 ug / mL against S. aureus ATCC 43300 and 1.76 ug / mL vs. a S. aureus MRSA strain. Streptomyces sp. 6E3 has an antimicrobial potential against S. aureus strains resistant to methicillin and non-resistant, being of interest carrying out of more studies on its active metabolites.

Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga / Antimicrobial Resistance Profiles of Bacterial Isolates in Patients with Urinary Tract Infections in a Reference Center in Bucaramanga / Perfil de resistência antimicrobiana de isulados bacterianos em pacientes com infecção urinária de um centro de referência em Bucaramanga

Introducción. Dentro de las infecciones bacterianas que afectan al ser humano, la infección de las vías urinarias es una de las más frecuentes, afectando hasta 150 millones de personas en el mundo cada año. El uso indiscriminado de antibióticos y su manejo inadecuado han generado un aumento en la resistencia antimicrobiana. El objetivo del presente estudio es describir patrones fenotípicos de resistencia antimicrobiana de los microorganismos más frecuentes en pacientes con diagnóstico de infección de vías urinarias en centro de referencia de Bucaramanga. Metodología. Estudio de corte transversal, muestreo no probabilístico en pacientes con sospecha o diagnóstico de infecciones de vías urinarias que requirieron manejo intrahospitalario en una institución de salud de alta complejidad durante julio del 2017 y abril del 2018, de quienes se obtuvo urocultivo y antibiograma. Resultados. De 120 pacientes incluidos, se obtuvo un reporte de 116 urocultivos. El microorganismo más frecuente fue Escherichia coli, seguido de Klebsiella pneumoniae. El primero presentó alta sensibilidad a carbapenémicos y aminoglucósidos, baja sensibilidad a la Ceftriaxona y a la Ampicilina/Sulbactam. Por otro lado, el microorganismo Klebsiella pneumoniae presentó alta sensibilidad a carbapenémicos, pero resistencia elevada a la Ampicilina/Sulbactam y a la Ceftriaxona. El antibiótico empírico más utilizado fue la Ceftriaxona. Discusión. La distribución de microorganismos aislados es comparable con la ya descrita a nivel nacional e internacional. Los perfiles de resistencia antimicrobiana tienen puntos comunes como la resistencia a los betalactámicos, pero difieren en algunos aspectos, como la resistencia a cefalosporinas y quinolonas. Conclusiones. Los microorganismos aislados presentan altas tasas de resistencia a los betalactámicos y a las cefalosporinas, las cuales son ampliamente utilizadas. Esta información debe orientar el desarrollo de protocolos que permitan optimizar la toma de decisiones clínicas con respecto a la terapia antibiótica. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):405-413. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Introduction. Among the bacterial infections that affect human beings, urinary tract infections are one of the most common, affecting up to 150 million people worldwide each year. Indiscriminate use of antibiotics and their improper handling has generated an increase in microbial resistance. This study's objective is to describe the phenotypic patterns of antimicrobial resistance of the most frequent microorganisms in patients with urinary tract infection diagnoses in a reference center in Bucaramanga. Methodology. A cross-sectional study with non probability sampling on patients with suspected or diagnosed urinary tract infections who required hospital treatment at a high-complexity health institution during July, 2017 and April, 2018, from whom urine cultures and antibiograms were obtained. Results. Out of 120 patients, a report was obtained for 116 urine cultures. The most frequent microorganism was Escherichia coli, followed by Klebsiella pneumoniae. The former presented high sensitivity to carbapenem antibiotics and aminoglycosides and low sensitivity to Ceftriaxone and Ampicillin/Sulbactam. On the other hand, the microorganism Klebsiella pneumoniae presented high sensitivity to carbapenem antibiotics, but elevated resistance to Ceftriaxone and Ampicillin/Sulbactam. The empiric antibiotic used most was Ceftriaxone. Discussion. The distribution of isolated microorganisms is comparable to that which has been described nationally and internationally. Antimicrobial resistance profiles have points in common, such as resistance to beta-lactams, but differ in some aspects, such as resistance to cephalosporins and quinolones. Conclusions. Isolated microorganisms present high rates of resistance to beta-lactams and cephalosporins, which are widely used. This information must guide developing protocols that allow optimizing clinical decision-making with respect to antibiotic therapy. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):414-422. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Introdução. Dentre as infecções bacterianas que afetam o homem, a infecção do trato urinário é uma das mais frequentes, afetando até 150 milhões de pessoas no mundo a cada ano. O uso indiscriminado de antibióticos e seu manejo inadequado têm gerado aumento da resistência antimicrobiana. O objetivo deste estudo é descrever padrões fenotípicos de resistência antimicrobiana dos microrganismos mais frequentes em pacientes com diagnóstico de infecção do trato urinário em um centro de referência em Bucaramanga. Métodos. Estudo transversal, com amostra não probabilística, em pacientes com suspeita ou diagnóstico de ITU que precisaram de manejo intra-hospitalar em uma instituição de saúde de alta complexidade no período de julho de 2017 a abril de 2018. Foram obtidos urocultura e antibiograma desses pacientes. Resultados. De 120 pacientes incluídos, foi obtido um relatório de 116 uroculturas. O microrganismo mais frequente foi Escherichia coli, seguido por Klebsiella pneumoniae. O primeiro apresentou alta sensibilidade a carbapenêmicos e aminoglicosídeos e baixa sensibilidade a Ceftriaxona e a Ampicilina/Sulbactam. Por outro lado, o microrganismo Klebsiella pneumoniae apresentou alta sensibilidade a carbapenêmicos, mas alta resistência a Ampicilina/Sulbactam e a Ceftriaxona. O antibiótico empírico mais amplamente utilizado foi a Ceftriaxona. Discussão. A distribuição dos microrganismos isolados é comparável àquela já descrita a nível nacional e internacional. Os perfis de resistência antimicrobiana têm pontos comuns como resistência aos beta-lactâmicos, mas diferem em alguns aspectos, como resistência às cefalosporinas e quinolonas. Conclusão. Microrganismos isolados apresentam altas taxas de resistência aos beta-lactâmicos e cefalosporinas, que são amplamente utilizados. Esta informação deve nortear o desenvolvimento de protocolos que permitam otimizar a tomada de decisão clínica em relação à antibioticoterapia. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):405-413. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Antimicrobial Resistance Profiles of Bacterial Isolates in Patients with Urinary Tract Infections in a Reference Center in Bucaramanga / Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga / Perfil de resistência antimicrobiana de isulados bacterianos em pacientes com infecção urinária de um centro de referência em Bucaramanga

Introduction. Among the bacterial infections that affect human beings, urinary tract infections are one of the most common, affecting up to 150 million people worldwide each year. Indiscriminate use of antibiotics and their improper handling has generated an increase in microbial resistance. This study's objective is to describe the phenotypic patterns of antimicrobial resistance of the most frequent microorganisms in patients with urinary tract infection diagnoses in a reference center in Bucaramanga. Methodology. A cross-sectional study with non probability sampling on patients with suspected or diagnosed urinary tract infections who required hospital treatment at a high-complexity health institution during July, 2017 and April, 2018, from whom urine cultures and antibiograms were obtained. Results. Out of 120 patients, a report was obtained for 116 urine cultures. The most frequent microorganism was Escherichia coli, followed by Klebsiella pneumoniae. The former presented high sensitivity to carbapenem antibiotics and aminoglycosides and low sensitivity to Ceftriaxone and Ampicillin/Sulbactam. On the other hand, the microorganism Klebsiella pneumoniae presented high sensitivity to carbapenem antibiotics, but elevated resistance to Ceftriaxone and Ampicillin/Sulbactam. The empiric antibiotic used most was Ceftriaxone. Discussion. The distribution of isolated microorganisms is comparable to that which has been described nationally and internationally. Antimicrobial resistance profiles have points in common, such as resistance to beta-lactams, but differ in some aspects, such as resistance to cephalosporins and quinolones. Conclusions. Isolated microorganisms present high rates of resistance to beta-lactams and cephalosporins, which are widely used. This information must guide developing protocols that allow optimizing clinical decision-making with respect to antibiotic therapy. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):414-422. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Introducción. Dentro de las infecciones bacterianas que afectan al ser humano, la infección de las vías urinarias es una de las más frecuentes, afectando hasta 150 millones de personas en el mundo cada año. El uso indiscriminado de antibióticos y su manejo inadecuado han generado un aumento en la resistencia antimicrobiana. El objetivo del presente estudio es describir patrones fenotípicos de resistencia antimicrobiana de los microorganismos más frecuentes en pacientes con diagnóstico de infección de vías urinarias en centro de referencia de Bucaramanga. Metodología. Estudio de corte transversal, muestreo no probabilístico en pacientes con sospecha o diagnóstico de infecciones de vías urinarias que requirieron manejo intrahospitalario en una institución de salud de alta complejidad durante julio del 2017 y abril del 2018, de quienes se obtuvo urocultivo y antibiograma. Resultados. De 120 pacientes incluidos, se obtuvo un reporte de 116 urocultivos. El microorganismo más frecuente fue Escherichia coli, seguido de Klebsiella pneumoniae. El primero presentó alta sensibilidad a carbapenémicos y aminoglucósidos, baja sensibilidad a la Ceftriaxona y a la Ampicilina/Sulbactam. Por otro lado, el microorganismo Klebsiella pneumoniae presentó alta sensibilidad a carbapenémicos, pero resistencia elevada a la Ampicilina/Sulbactam y a la Ceftriaxona. El antibiótico empírico más utilizado fue la Ceftriaxona. Discusión. La distribución de microorganismos aislados es comparable con la ya descrita a nivel nacional e internacional. Los perfiles de resistencia antimicrobiana tienen puntos comunes como la resistencia a los betalactámicos, pero difieren en algunos aspectos, como la resistencia a cefalosporinas y quinolonas. Conclusiones. Los microorganismos aislados presentan altas tasas de resistencia a los betalactámicos y a las cefalosporinas, las cuales son ampliamente utilizadas. Esta información debe orientar el desarrollo de protocolos que permitan optimizar la toma de decisiones clínicas con respecto a la terapia antibiótica. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):405-413. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Introdução. Dentre as infecções bacterianas que afetam o homem, a infecção do trato urinário é uma das mais frequentes, afetando até 150 milhões de pessoas no mundo a cada ano. O uso indiscriminado de antibióticos e seu manejo inadequado têm gerado aumento da resistência antimicrobiana. O objetivo deste estudo é descrever padrões fenotípicos de resistência antimicrobiana dos microrganismos mais frequentes em pacientes com diagnóstico de infecção do trato urinário em um centro de referência em Bucaramanga. Métodos. Estudo transversal, com amostra não probabilística, em pacientes com suspeita ou diagnóstico de ITU que precisaram de manejo intra-hospitalar em uma instituição de saúde de alta complexidade no período de julho de 2017 a abril de 2018. Foram obtidos urocultura e antibiograma desses pacientes. Resultados. De 120 pacientes incluídos, foi obtido um relatório de 116 uroculturas. O microrganismo mais frequente foi Escherichia coli, seguido por Klebsiella pneumoniae. O primeiro apresentou alta sensibilidade a carbapenêmicos e aminoglicosídeos e baixa sensibilidade a Ceftriaxona e a Ampicilina/Sulbactam. Por outro lado, o microrganismo Klebsiella pneumoniae apresentou alta sensibilidade a carbapenêmicos, mas alta resistência a Ampicilina/Sulbactam e a Ceftriaxona. O antibiótico empírico mais amplamente utilizado foi a Ceftriaxona. Discussão. A distribuição dos microrganismos isolados é comparável àquela já descrita a nível nacional e internacional. Os perfis de resistência antimicrobiana têm pontos comuns como resistência aos beta-lactâmicos, mas diferem em alguns aspectos, como resistência às cefalosporinas e quinolonas. Conclusão. Microrganismos isolados apresentam altas taxas de resistência aos beta-lactâmicos e cefalosporinas, que são amplamente utilizados. Esta informação deve nortear o desenvolvimento de protocolos que permitam otimizar a tomada de decisão clínica em relação à antibioticoterapia. Cómo citar. Delgado-Serrano J, Albarracín MJ, Rangel-Vera JA, Galeano-Salazar E, Niño-Vargas D, Wilches-Cuadros MA, Et al. Perfil de resistencia antimicrobiana de aislamientos bacterianos en pacientes con infección urinaria de un centro de referencia en Bucaramanga. MedUNAB. 2020;23(3):405-413. Doi: doi.org/10.29375/01237047.3950

Recuperación de bacterias aerobias y anaerobias de pacientes con apendicitis aguda mediante botellas de hemocultivo / Recovery of aerobic and anaerobic bacteria from patients with acute appendicitis using blood culture bottles

Introducción. La apendicitis aguda es la primera causa de abdomen agudo; sin embargo, poco se conoce sobre las bacterias asociadas y su perfil de sensibilidad. Objetivo. Identificar y determinar el patrón de resistencia de las bacterias aerobias y anaerobias aisladas en cultivo de líquido periapendicular tomado de los pacientes con apendicitis aguda, y establecer la proporción de bacterias según la fase clínica. Materiales y métodos. Se llevó a cabo un estudio descriptivo y prospectivo en el Hospital Universitario de San José de Bogotá (Colombia), en pacientes mayores de 16 años sometidos a apendicectomía abierta. Se tomaron muestras de líquido periapendicular, las cuales se sembraron directamente en botellas de hemocultivos para aerobios y anaerobios. Resultados. Se incluyeron 154 pacientes. Del total de cultivos, el 87 % (n=134) fueron positivos: 77 % (n=118) para aerobios y 51 % (n=79) para anaerobios. La proporción de cultivos positivos fue inferior en los casos de apendicitis no complicada, en comparación con aquellos de apendicitis complicada (80 % (66/83) Vs. 95 % (67/71); p=0,003). Los microorganismos aislados con mayor frecuencia fueron: Escherichia coli (53 %) (n=84), Bacteroides sp. (25 %) (n=25), Propionibacterium acnes (21 %) (n=21), Staphylococci coagulasa negativo (17 %) (n=27), Enterococcus sp. (10 %) (n=15) y Fusobacterium sp. (11 %) (n=11). La sensibilidad de E. coli a la amplicilina sulbactam fue de 30 %. La sensibilidad de Bacteroides spp. a la clindamicina y la ampicilina sulbactam fue de 91 %. El 100 % de los anaerobios fueron sensibles a piperacilina tazobactam, ertapenem, meropenem y metronidazol. Conclusiones. Los cultivos intraoperatorios son pertinentes en la apendicitis para determinar el patrón epidemiológico local, y establecer los antibióticos profilácticos y terapéuticos para esta enfermedad. Su siembra directa en botellas de hemocultivo permite una gran recuperación de microorganismos.

Introduction: Acute appendicitis is the first cause of acute abdomen, however, there is a little information about the associated bacteria and its sensibility profile. Objetive: To identify and to determine the resistance pattern of aerobic and anaerobic bacteria isolated in periapendicular fluid cultures taken in patients with acute appendicitis and to establish the proportions of isolates according to the clinical phase. Materials and methods: A descriptive and prospective study was undertaken at the Hospital Universitario de San José (Bogotá, Colombia) of patients older than sixteen years of age, undergoing an open appendectomy. A sample of periappendiceal fluid was taken, which was deposited directly into aerobic and anaerobic blood culture bottles. Results: One hundred and fifty-four patients were included. The overall positivity of cultures was 87% (n=1344); 77% (n=118) for aerobes and 51% (n=79) for anaerobes. The proportion of positive cultures was lower in the uncomplicated appendicitis cases as compared to the complicated ones (80% (66/83) vs. 95%(67/71), p = 0.003). The microorganisms isolated most frequently were: Escherichia coli (53%) (n=84); Bacteroides spp. (25%) (n=25); Propionibacterium acnes (21%) (n=21); coagulase negative Staphylococci (17%) (n=27); Enterococcus spp. (11%) (n=15), and Fusobacterium spp. (11%) (n=11). The sensitivity of E.coli to ampicillin/sulbactam was 30%. The sensitivity of Bacteroides spp. to clindamycin and ampicillin/sulbactam was 91%. All anaerobe isolates were sensitive to piperacillin/tazobactam, ertapenem, meropenem and metronidazole. Conclusions: Intraoperative cultures in acute appendicits are relevant in order to determine the local epidemiological pattern and to establish prophylactic and therapeutic antibiotics for this pathology; direct inoculation in blood culture bottles allows a high recovery of microorganisms.

Susceptibilidad antimicrobiana y mutaciones en el gen ARNr 23S de Helicobacter pylori en pacientes dispépticos / Antimicrobial susceptibility and mutations in the 23S rRNA gen of Helicobacter pylori in dyspeptic patients

RESUMEN Con el objetivo de evaluar la susceptibilidad antimicrobiana y detectar mutaciones puntuales en el gen ARNr 23S en cepas de Helicobacter pylori se realizó un estudio transversal que incluyó a 95 pacientes con dispepsia atendidos en una clínica privada de Lima. Mediante endoscopía se colectaron biopsias de antro para el aislamiento de cepas de Helicobacter pylori para la evaluación de la susceptibilidad antimicrobiana empleando la técnica de microdilución en caldo. La detección de mutaciones puntuales se desarrolló mediante PCR-RFLP. El porcentaje de infección por Helicobacter pylori fue de 46,3%, se observaron valores de resistencia de 52,3% a claritromicina, 29,6% a metronidazol, 45,5% a levofloxacino y 4,6% a amoxicilina. El porcentaje de mutaciones puntuales A2142G y A2143G asociados a resistencia a claritromicina fue 43,5%. En conclusión, encontramos que las tasas de resistencia antimicrobiana y el porcentaje de cepas de Helicobacter pylori circulantes en una clínica privada de Lima fueron elevadas.

ABSTRACT In order to evaluate antimicrobial susceptibility and detect specific mutations in the 23S rRNA gene in Helicobacter pylori strains, a cross-sectional study was performed on 95 patients with dyspepsia treated in a private clinic in Lima. Antrum biopsies were collected by endoscopy for isolation and evaluation of antimicrobial susceptibility using the broth microdilution method. The detection of specific mutations was developed by PCR-RFLP. The percentage of infection by Helicobacter pylori was 46.3%. Resistance values of 52.3% to clarithromycin, 29.6% to metronidazole, 45.5% to levofloxacin, and 4.6% to amoxicillin were observed. The percentage of specific A2142G and A2143G mutations associated with clarithromycin resistance was 43.5%. In conclusion, we found that antimicrobial resistance rates and the percentage of Helicobacter pylori strains circulating in a private clinic in Lima were high.

Evaluación de la actividad antimicrobiana del hidróxido de calcio combinado con diferentes concentraciones de omeprazol frente a enterococcus faecalis / Evaluation of the antimicrobial activity of calcium hydroxide combined omeprazole against enterococcus faecalis

Resumen Objetivos: Evaluar la actividad antimicrobiana del hidróxido de calcio en combinación con omeprazol, a diferentes concentraciones, frente a E. faecalis. Materiales y métodos: Estudio experimental in vitro en el que se probó la actividad antimicrobiana del hidróxido de calcio y de hidróxido de calcio más omeprazol en diferentes concentradones (1, 5, 8 y 10 %) frente a E. faecalis, determinando la sensibilidad antimicrobiana en cada uno de los grupos. El análisis estadístico de los datos se realizó mediante la prueba estadística Shapiro Wilk y luego se utilizó la prueba no paramétrica de U Mann-Whitney. Resultados: Se obtuvo una notable sensibilidad de la bacteria al omeprazol, la cual se incrementa a medida que se aumenta la concentración de omeprazol. El grupo de hidróxido de calcio con omeprazol al 10 % tuvo el mayor porcentaje de inhibición (87,7), luego al 8 % con (71,9), al 5 % (67,8) y al 1 % (64,1). Conclusiones: Hay un notable incremento de la actividad antimicrobiana de hidróxido de calcio combinado con omeprazol frente a Enterococcus faecalis.

Abstract Objetive: Evaluate the antimicrobial activity of calcium hydroxide in combination with omeprazole at different concentrations, against Enterococcus faecalis. Materials and methods: An in vitro experimental study in which the antimicrobial activity of calcium hydroxide and calcium hydroxide plus omeprazole at different concentrations (1 %, 5 %, 8 %, and 10 %) was tested against E. faecalis, determining the antimicrobial sensitivity in each of the groups. Statistical analysis of the data was performed using the Shapiro-Wilk statistical test and then the non-parametric Mann-Whitney test was used. Results: A remarkable sensitivity of the bacteria to omeprazole was observed, which increased as the concentration of omeprazole increases. The calcium hydroxide group plus omeprazole at 10 % had the highest percentage of inhibition (87.7) then 8 % with (71.9), 5 % (67.8) and 1 % (64.1). Conclusions: There is a significant increase in the antimicrobial activity of calcium hydroxide combined with omeprazole against Enterococcus faecalis.